公表された母集団PKモデルの再実装
公表された母集団PKモデルを、論文の表や補足資料から自分のソフトウェアで作り直し、公表値を再現できるか確かめる。元の患者データなしで、新しい問いを立てられる。
定義
公表された母集団PK（PopPK）モデルの再実装とは、論文、その表、補足資料（多くはNONMEMのコード）から、モデルの構造、典型値、共変量の効果、個体差を、自分が扱えるソフトウェア（たとえばRのrxode2やPython）で作り直すことである。元の患者データは要らない。
目的
再実装したモデルなら、論文が扱っていない問いに答えられる。たとえば、別の投与間隔で曝露がどう変わるか、体重の分布で曝露がどうばらつくか、不確かさつきで報告されたパラメータに結論がどれだけ敏感か、である。
確かめ方
- 論文にある典型値や曝露の要約を再現する。
- 重要な出力を、別の実装（別のソルバーや別の言語）で計算し直して比べる。
- 元の資料の不一致（たとえば表の値と脚注の値が違う）はすべて記録し、両方を感度解析として試す。
示せないこと
公表値と一致することは、モデルを正しく作り直せたことを示す。新しい患者集団や新しい投与方式を予測するモデルとして妥当かどうかは、別のことである。mosunetuzumabの再実装はこの2点を分けて扱い、抗PD-1抗体の用量方式の解析は、2つのモデルを再実装して独立の計算と照合している。
よくある質問
PopPKモデルを再実装するのに、元の患者データは必要ですか。
要りません。論文と補足資料に載っている構造、典型値、共変量の効果、個体差があれば作り直せます。元のデータが必要なのは、妥当性の確認や再推定のときだけです。
公表された曝露を再現できれば、新しい投与方式にも妥当だといえますか。
いえません。モデルを正しく作り直せたことを示すだけです。別の集団や投与方式への予測には、別の根拠が必要です。