Daiki Kumakura

熊倉大騎

I am a mathematical biologist and a bioinformatics researcher in the pharmaceutical industry. I received my Ph.D. in Life Science from Hokkaido University in March 2025.

I study biological dynamics using mathematical models and data analysis, with an interest in pharmacometrics and systems biology.

Data processing and quantitative modeling illustration

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Blog · 2026-10-27 · Japanese

測定していない薬の細胞応答をAIはどう予測するのか

MAPの未測定薬剤予測を、残した知識と未知にした情報から読む。公開された16薬剤の評価値を再集計し、平均相関の改善、候補ごとのばらつき、知識学習の段階差と次の検証条件を整理する。

Blog · 2026-10-26 · Japanese

観測されない媒介変数はネットワークから消えてくれない

観測データから推定したネットワークのエッジと、実際の分子の作用を区別する。媒介変数を消去した数理と合成データの計算例で、当てはまっても媒介物のパラメータが決まらないことを示し、微生物の化学媒介相互作用、single-cellの遺伝子調節ネットワーク、創薬の機序評価へつなげる。

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